Fue establecida dentro de las atarazanas para la cobranza del almojarifazgo de las Indias . Inicialmente debió ser una mera adaptación, ya que en 1527 se inaugura una obra, de gran envergadura, realizada bajo la asistencia del Conde de Orgaz .

La recaudación era ingente; Morgado dice, de ese año,"cuyas rentas suelen andar arrendada en setecientos y tantos mil ducados sin las costas de su administración".

Con el tiempo se llegó a la suma de trescientos seis millones de maravedíes , además de los derechos del Rey que ascendían a tres millones.

Un incendio, intencionado, la destruyó en 1792. Hubo de levantarse otro edificio, siendo asistentes el marqués de Uztáriz y D. José de Valos, que fue incomprensiblemente destruido en nuestra época para realizar allí la pesada mole de la Delegación de Hacienda.